复旦大学出版社成立于1980年，2009年改为复旦大学出版社有限公司，系国家教育部主管、复旦大学主办的综合性大学出版社。

复旦大学出版社有限公司现设人文编辑部、社科编辑部、理科编辑部、经济管理分社、医学分社、外语分社、学前教育分社、南怀瑾项目组、社会读物项目组、现代学徒制教材项目组、大词典项目组、质检中心、校对室、版权部、法务部、装帧设计部、出版部、宣传策划部、营销部、院校合作部、储运部、社办公室、总编办、财务部等机构，下辖上海复旦大学电子音像出版社有限公司、上海复旦经世书局有限公司两家独立核算机构。

复旦大学出版社有限公司系较早获得认定的国家一级出版社，在国内出版界和大学出版社集群中有着重要的影响力。复旦社定位于原创性学术著作和高校优秀教材出版，强调出版社尤其是大学出版社应该承担起主体出版的重任，坚持大学出版为大学教学与科研服务的宗旨，强化学术出版功能，为繁荣学术和优秀文化的传承做出贡献。在全国大学出版社中，无论获奖等级还是获奖数量和比例，均位居前列。