深圳实验学校中学部位于福田区百花六路，是深圳实验学校的发源地。中学部始终秉承实验学校办学理念，扎实推进健全人格教育，积极落实有效教学。强调对教师、学生严格要求，规范管理，注重精细务实，努力办成精品学校。

由于集团化的办学优势，中学部与各部实现教师资源共享。中学部教师中有全国劳动模范、广东省“五一劳动奖章”获得者、有“深圳市‘三八’红旗手、有“南粤教坛新秀”、有“广东省中小学名班主任工作室主持人”、有“深圳市名师工作室主持人”、有“深圳市优秀教师”、有“高考先进工作者”等。他们经验丰富，责任心强，充满活力，有着高尚的职业操守，所教学生无论在品德还是学业方面都取得优异成绩。

学校交响乐团、科技活动中心、天文小组均在中学部。此外还有视觉社、银球社、“小伙伴”学生电视台等30多个学生社团活跃在校园，为培养学生兴趣与特长提供了广阔的平台。每年开展的读书节、科技节、体育文化节、艺术文化节、秋季社会实践周、语言思维文化活动周、“校长杯”篮球、足球赛等活动课程精彩纷呈。

由于中学部特别关注校园文化建设，关注学生终身发展，倡导“文化立校”、“阅读立校”的办学思路，努力为师生创设良好的读书氛围，全方位打造书香校园。2008年，中学部被评为广东省首批“书香校园”；2011年，获广东省“朝阳读书”先进集体荣誉称号。此外，中学部还特别关注学生日常行为习惯，努力培养学生遵纪守法、文明守纪、礼仪诚信等。所以，从这里毕业的学生，不但学业有很大进步，学生的综合素质和各方面能力都得到了很好的锻炼和提高，为成为优秀公民奠定了良好的基础。