浙江省杭州第二中学历史悠久，是现代班级授课制学校之一，前身为1899年由美国传教士甘惠德创建的私立蕙兰中学和1940年由原浙江大学校长竺可桢先生创办的国立浙江大学附属中学。1951年两校在“蕙兰”原址合并，改称“浙江省杭州第二中学”。 2001年学校实施跨江发展，学校在钱塘江南岸滨江区建成新校区。目前已形成一校两区（滨江校区和东河校区）的格局。

1978年，学校被认定为浙江省重点中学，是浙江省首批办好的18所重点中学之一；1995年被评为浙江省首批一级重点中学；2014年，被评为浙江省首批一级普通高中特色示范学校。

多年来，学校办学业绩一直被社会瞩目，荣誉卓著。1983年被教育部评为“‘五讲四美’为人师表活动先进集体”；1999年被评为“全国精神文明建设先进单位”；2003年学校再次被确定为“全国精神文明建设先进单位”；2007年被教育部评为“全国教育系统先进集体”；2011年被“中国教育报刊社”选为“全国百强特色学校十佳示范学校”；特别是2011年底，学校荣获杭州市教育系统唯一的“全国文明单位”的称号；2012年，学校党总支又被评为全省基础教育界唯一的“全国创先争优先进基层党组织”。2013年，美国华盛顿中国研究中心评选的中国高中排名榜中，我校荣膺全国第五。2016年，成为中国教育发展战略学会首届高中教育专业委员会理事长单位。2017年，学校相继被评为首批全国文明校园，全国科技教育创新十佳学校，全国青少年校园足球特色学校。

杭州二中秉承百年历史名校的优良办学传统和深厚的文化底蕴，信守“让能飞的飞起来，让会飞的飞更高”的办学理念，崇尚基于科学和民主的“高、正、实”的校园精神，坚持“思想解放、行为规范”原则，追求“高境界做人、高水平学习、高品质生活”办学境界，以“开明、开化、开放”，“宽松、宽容、宽厚”，“人性、灵性、理性”的文化浸润人心，努力营造一个能够让所有学生都愉快成长、卓越发展的学习空间。多年来，学校在素质教育上矢志不渝的追求，深受全社会的信赖和赞誉，赢得了百姓的口碑。

学校积极推行“11+1”素质培养新模式，人人“会游泳、能自救、重健身、懂艺术、能开口、讲礼仪、爱实践、愿上岗、会服务、进社团、懂规划+会开车”，努力使每一位在二中同学有充分锤炼、展示和提高的平台，在充满青春活力的校园生活中获得学情、友情和亲情。学校设有传媒特色班和A-level 课程班。创办了62个社团以及14个体育俱乐部为载体打造同学们的活动平台，创设了“读书节”、“科技节”、“体育文化节”、“艺术节”、“社团节”、“生活技能节”等校园活动节，形成了深受学生欢迎的校园活动系列。学校还与美国、英国、德国、澳大利亚、加拿大、日本、新加坡等国的学校建立了校际合作关系，每年都组织教师和学生到境外学习、交流。2016年学校成功举办哈佛大学中美学生领袖峰会，并成为永久会场，每年有数十名哈佛大学明星授课人来校授课。

学校办学成果斐然，其高质量的教育教学名重省内外。在全国青少年科技创新大赛、DI创新思维大赛、英特尔国际科学与工程大赛、国际太空城市设计大赛、FTC国际机器人大赛、哈佛大学中国大智汇创新研究挑战赛等国内外高端赛事中也屡获佳绩。