一、绕组与电气结构不同
隔离变压器采用双绕组独立结构，一次绕组和二次绕组相互独立、完全绝缘，无任何电气连接，仅通过铁芯磁场传递能量，实现输入输出电路的完全隔离。而自耦变压器为单绕组共用结构，一次侧与二次侧共用部分绕组，输入输出端存在直接电气连接，并非完全隔离的电磁转换模式，这是二者最核心的区别。
二、安全防护性能不同
隔离变压器的电气隔离特性，可隔断市电地线、零线干扰，避免高压侧故障、漏电传导至低压侧，人体单侧接触输出线路不会形成触电回路，安全防护等级高。自耦变压器因高低压侧电气互通，高压侧漏电、过压故障会直接传递到低压输出端，无法规避触电风险，安全防护能力薄弱。
三、适用场景不同
隔离变压器多用于精密仪器、医疗设备、弱电控制系统等对供电稳定性、用电安全性要求高的场景，可抑制电网谐波、杂波干扰。自耦变压器主要用于工业常规调压、大功率电力输送、电压匹配等对安全性要求较低、侧重效率的场景。
