1983年，从山西农业大学毕业后进入北京农业大学就读研究生。
1986年，硕士毕业于北京农业大学之后留校任教。
1991年，前往牛津大学攻读博士学位。
1995年，获得博士学位后先后在卡尔加里大学、牛津大学、哈佛大学/哈佛医学院从事博士后研究工作。
2001年，担任牛津大学讲师、实验室主任、博士生导师。
2004年，进入中国科学院微生物研究所工作，担任研究员、博士生导师，所长。
2008年，出任中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室主任。
2015年，担任中国科学院大学存济医学院院长。
2017年 - 2022年，担任中国疾病预防控制中心主任。
2018年，担任第八届国家自然科学基金委员会副主任。
2008年，荣获第一届“谈家桢生命科学创新奖”。
2013年，当选中国科学院院士。
2014年，当选第三世界科学院院士。
2014年09月，荣获第七届“谈家桢生命科学成就奖”。
2015年，荣获“何梁何利基金科学与技术进步奖”。
2016年06月02日，荣获首届“全国杰出科技人才”奖。
2017年05月，荣获全国创新争先奖章。
2019年，先后当选美国国家科学院外籍院士、美国国家医学科学院外籍院士。
2020年，当选德国国家科学院院士。
2022年05月，入选英国皇家科学院外籍院士、澳门城市大学荣誉博士。
2022年06月，当选俄罗斯科学院外籍院士。
国家科学技术进步奖特等奖
国家科学技术进步奖一等奖
国家科学技术进步奖二等奖
中华医学科技奖一等奖
中华预防医学会科学技术奖一等奖
北京市科学技术奖一等奖
