1992年，出任葡萄牙体育一线队主教练。
1996-97赛季，深得罗布森重用的随罗布森转投巴萨。
2001年，出任莱利亚一线队主教练，并于2001-02赛季中期率领球队排在联赛第五名。
2002-03赛季，带领波尔图夺得葡超联赛冠军、葡萄牙杯冠军和欧洲联盟杯冠军。
2003-04赛季，不仅率领波尔图卫冕葡超冠军，还率队在欧冠中夺得冠军。
2004年7月，正式出任切尔西一线队主教练。在执教首个赛季就夺得英超冠军、英联冠军。
2005-06赛季初，率队在英格兰社区盾杯决赛中，夺得冠军。
2006年，卫冕了英超冠军，还率队拿到了足总杯与英联杯两项冠军。
2008年6月，被任命为国际米兰一线队主教练，率领国际米兰在意大利超级杯决赛中历经点球大战击败罗马，夺得意超杯冠军，提前3轮夺得意甲冠军。
2010年，国际米兰成功夺得意大利杯冠军、意甲冠军和欧冠冠军，加冕“三冠王”。
2010-11赛季，率领皇马夺得国王杯冠军。
2011年5月，率领皇马提前两轮夺得阔别4年的西甲冠军。
2012-13赛季初，率队在西班牙超级杯，夺得冠军。
2013年6月，时隔六年重返斯坦福桥，第二次被切尔西任命为一线队主教练。
2014年，率队提前3轮夺得英超冠军，还捧起英超冠军奖杯。
2016年5月，被任命为曼联一线队主教练。
2016-17赛季初，在社区盾决赛中，率队击败英超卫冕冠军莱斯特城，夺得社区盾冠军。在欧联决赛、英联杯中，率队夺得冠军。
2019年11月，担任热刺教练。
2021年5月，与罗马达成执教协议，双方签订了一份为期三年的合同。
2021-22赛季，在欧协联赛场，率队夺得欧冠冠军。
2022年，葡萄牙足协教练奖。
2022年，欧洲协会联赛冠军。
2021年，IFFHS最佳俱乐部教练。
2017年，英格兰足球联盟杯冠军。
2017年，欧罗巴联赛冠军。
2016年，英格兰社区盾冠军。
2015年，英格兰足球超级联赛冠军。
2015年，英格兰足球联盟杯冠军。
2015年，英超最佳教练。
2015年，21世纪葡萄牙最佳教练。
2013年，IFFHS最佳俱乐部教练。
2012年，西班牙足球甲级联赛冠军。
2012年，西班牙超级杯冠军。
2012年，环球足球奖最佳教练。
2011年，西班牙国王杯冠军。
2011年，国际足联最佳教练。
2011年，IFFHS最佳俱乐部教练。
2011年，欧足联最佳阵容。
2010年，欧洲冠军联赛冠军。
2010年，意大利足球甲级联赛冠军。
2010年，意大利杯冠军。
2010年，意甲奥斯卡最佳教练。
2009年，意大利足球甲级联赛冠军。
2009年，意甲奥斯卡最佳教练。
2008年，意大利超级杯冠军。
2007年，英格兰足总杯冠军。
2007年，英格兰足球联盟杯冠军。
2006年，英格兰足球超级联赛冠军。
2006年，IFFHS最佳俱乐部教练。
2006年，英超最佳教练。
2006年，欧足联最佳阵容。
2005年，英格兰足球超级联赛冠军。
2005年，英格兰足球联盟杯冠军。
2005年，英格兰社区盾冠军。
2005年，IFFHS最佳俱乐部教练。
2005年，英超最佳教练。
2005年，欧足联最佳阵容。
2005年，欧足联最佳教练。
2004年，欧洲冠军联赛冠军。
2004年，葡萄牙足球超级联赛冠军。
2004年，欧足联最佳阵容。
2004年，欧足联最佳教练。
2003年，葡萄牙足球超级联赛冠军。
2003年，葡萄牙杯冠军。
2003年，葡萄牙超级杯冠军。
2003年，欧洲联盟杯冠军。
穆里尼奥是世界最佳主帅，因为穆里尼奥是一个很直接的人，他的球员也曾经告诉我，他是一个有话就当面说的人。（拜仁名宿洛塔尔·马特乌斯评）
穆里尼奥是世界上最好的教练，事实上在众多优秀教练中挑出一个最好的并不容易，不过他已经在不同的国家取得了巨大的胜利。（时任巴塞罗那主教练何塞普·瓜迪奥拉评）
在所有球队的主教练中，意大利国际米兰主教练穆里尼奥是当之无愧的最佳教练。（“球王”迭戈·马拉多纳评）
穆里尼奥是一个成功的男人，一个赢家。他配得上最佳教练的荣誉，我认为他打造了最好的球队阵容。（曼联功勋教练亚历克斯·弗格森评）
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