1982年07月，毕业于复旦大学生物系，获学士学位。
1990年12月，获美国普渡大学生物化学系博士学位。
1990年12月－1992年11月，在美国普渡大学生物系、生物化学系从事博士后研究工作，任访问讲师。
1992年11月－1994年12月，任上海普洛麦格生物产品有限公司副研究员、生产经理。
1994年12月－1997年01月，任中国科学院上海植物生理研究所研究员、室主任、博士生导师、副所长。
1997年01月－1999年07月，任中国科学院上海生物工程研究中心研究员、室主任、博士生导师、主任。
2002年02月起，任中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所研究员、博士生导师，国家人类基因组南方研究中心执行主任，生物芯片上海国家工程研究中心主任。
2005年，当选为中国科学院院士。
2008年07月起，任香港中文大学微生物学系、李嘉诚健康科学研究所和威尔斯亲王医院教授。
2011年，当选为发展中国家科学院院士。
2014年，被普渡大学授予荣誉博士学位。
2001年，荣获“上海科技进步二等奖”。
2002年，研究项目《遗传性乳光牙本质致病基因的研究》荣获“国家自然科学二等奖”。
2002年，荣获“国家科技进步二等奖”、“上海科技进步一等奖”。
2005年，研究项目《广东省传染性非典型肺炎（SARS）防治研究》荣获“国家科学技术进步奖二等奖”。
2005年，研究项目《钩端螺旋体全基因组测序和部分功能的研究》荣获“上海市科学技术进步奖”。
2006年，研究项目《SARS冠状病毒分子进化及其相关流行病学规律的研究》荣获“上海市自然科学奖一等奖”。
2008年，荣获“上海市自然科学奖二等奖”。
