卫生部发布的《医疗机构诊疗科目名录》，诊疗科目分为“一级科目”和“二级科目”。一级科目一般相当临床一级学科，如“内科”、“外科”等；二级科目一般相当临床二级学科，如“呼吸内科”、“消化内科”等。为便于专科医疗机构使用，部分临床二级学科列入一级科目。
| 序号 | 诊疗科目名称(一级) | 诊疗科目名称(二级) |
| 1 | 预防保健科 | |
| 2 | 全科医疗科 | |
| 3 | 内科 | |
| 3—1 | 呼吸内科专业 | |
| 3—2 | 消化内科专业 | |
| 3—3 | 神经内科专业 | |
| 3—4 | 心血管内科专业 | |
| 3—5 | 血液内科专业 | |
| 3—6 | 肾病学专业 | |
| 3—7 | 内分泌专业 | |
| 3—8 | 免疫学专业 | |
| 3—9 | 变态反应专业 | |
| 3—10 | 老年病专业 | |
| 3—11 | 其他 | |
| 4 | 外科 | |
| 4—1 | 普通外科专业 | |
| 4—2 | 神经外科专业 | |
| 4—3 | 骨科专业 | |
| 4—4 | 泌尿外科专业 | |
| 4—5 | 胸外科专业 | |
| 4—6 | 心脏大血管外科专业 | |
| 4—7 | 烧伤科专业 | |
| 4—8 | 整形外科专业 |
说明：《医疗机构诊疗科目名录》是卫生部依据临床一、二级学科及专业名称编制，也是卫生行政部门核定医疗机构诊疗科目，填写《医疗机构执业许可证》和《医疗机构申请执业登记注册书》相应栏目的标准。 值得注意的是在医疗机构实际设置的临床专业科室名称不受本《医疗机构诊疗科目名录》限制，可使用习惯名称和跨学科科室名称，如“围产医学科”、“五官科”等。
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