1986年，从复旦大学生物系毕业，考入中国科学院昆明动物研究所就读研究生。
1991年，获得中国科学院昆明动物研究所博士学位后留所工作。
1992年，前往美国圣地亚哥动物协会做博士后研究。
1995年，回到中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放研究实验室，担任研究员、博士生导师、主任。
1999年，担任云南省畜禽分子生物学重点实验室主任。
2003年，当选为中国科学院院士。
2005年，担任中国科学院昆明动物研究所所长。
2007年，当选为发展中国家科学院院士。
2008年，当选为云南省科学技术协会第七届委员会主席。
2009年07月，被聘为昆明学院名誉院长。
2012年至今，担任中国科学院副院长。
1996年，项目《猕猴属的分子进化研究》获得“云南省自然科学一等奖”。
1997年，项目《中国若干特有珍稀动物类群的细胞与分子进化研究》获得“国家自然科学三等奖”。
2001年，项目《滇金丝猴生物学研究》获得“云南省自然科学一等奖”。
2002年，获得第三届国际“生物多样性领导奖”（第一位亚洲获奖学者）。
2003年，项目《云南汉族系统性红斑狼疮与补体C4 C2基因相关性研究》获得“云南省科技进步三等奖”。
2005年，项目《线粒体基因组多样性与东亚人群历史的研究》获得“云南省自然科学一等奖”。
2005年，获得“云南省科学技术突出贡献奖”。
2006年，项目《线粒体基因组多样性与东亚人群历史的研究》获得“国家自然科学二等奖”。
2009年，获得第二届“谈家桢生命科学成就奖”。
2013年，项目《基因组多样性与亚洲人群的演化》获得“云南省自然科学特等奖”。
2014年，项目《基因组多样性与亚洲人群的演化》获得“国家自然科学奖二等奖”。
