| 序号 | 医院名称 | 所在地 | 医院等级 | 
|---|---|---|---|
| 新疆医科大学第一附属医院 | 乌鲁木齐 | 三甲医院 | |
| 新疆维吾尔自治区人民医院 | 乌鲁木齐 | 三甲医院 | |
| 新疆医科大学第二附属医院 | 乌鲁木齐 | 三甲医院 | |
| 石河子大学医学院第一附属医院 | 石河子市 | 三甲医院 | |
| 阿克苏地区第一人民医院 | 阿克苏地区 | 三甲医院 | |
| 昌吉回族自治州人民医院 | 昌吉回族自治州 | 三甲医院 | |
| 新疆维吾尔自治区中医医院 | 乌鲁木齐 | 三甲医院 | |
| 喀什地区第二人民医院 | 喀什地区 | 三甲医院 | |
| 巴音郭楞蒙古自治州人民医院 | 巴音郭楞蒙古自治州 | 三甲医院 | |
| 喀什地区第一人民医院 | 喀什地区 | 三甲医院 | |
| 新医大附属肿瘤医院 | 乌鲁木齐 | 三甲医院 | |
| 克拉玛依市中心医院 | 克拉玛依市 | 三甲医院 | |
| 克州人民医院 | 克孜勒苏柯尔克孜自治州 | 三甲医院 | |
| 伊犁州友谊医院 | 伊犁哈萨克自治州 | 三甲医院 | |
| 独山子人民医院 | 克拉玛依市 | 二级医院 | |
| 库车市人民医院 | 阿克苏地区 | 二级医院 |