芙蓉南站位于长沙生态动物园入口处南侧，按照高架车站设计建设，远期高峰小时发送量为1381人。站房总建筑面积2500平方米，站房呈东西向布置，旅客流线设计为上进上出的形式。总用地面积超过2万平方米，主要建设内容为地上、地下双层停车场、公交首末站、出租车落客候客区以及其他配套设施等，是长株潭城际铁路站点之一。