皮央和东嘎遗址的具体创建年代暂时无法确定。有关文献记载也极少，只有一本流传到印度的藏文手抄本《古格普兰王国文》，其中记载皮央寺始建于古格王国建国初期的10世纪，为仁钦桑波当时所建的古格八大佛寺之一，七十年之后又有一次规模较大的改建。另有藏文文献提及东嘎在意希沃时代的10世纪建寺，约12世纪前后由于古格王国国内的分裂斗争，一度成为与都城扎布让对峙的另一个王室的所在地，后来古格王国恢复统一，东嘎丧失了王宫的地位，但仍为古格的政治及文化要地。

皮央和东嘎遗址存留的石窟总数将近千座，包括礼佛窟、禅窟、僧房窟、仓库窟、厨房窟等各种类型的石窟。礼佛窟内绘有壁画，内容有佛、菩萨、飞天、比丘、供养人像、佛传故事、礼佛图、说法图、密宗曼荼罗、动物、植物、装饰图案。

皮央石窟共分为四个区，编入洞窟872窟。皮央石窟大体上可划分为前山区、后山区。前山区编为第Ⅰ区，洞窟基本呈自北向南直线分布，编号顺序从沟谷北端开始往南，共编为第1至433号窟。后山区编为第Ⅱ区、第Ⅲ区，其中第Ⅱ区洞窟的布局从自北向南转为由东向西，略呈“U”形分布，共编入洞窟145窟；第Ⅲ区自谷底折向西面，直到皮央遗址的西端，共编入洞窟247窟。皮央遗址的山顶还分布有一些洞窟，编为第Ⅳ区，共编为第1至37号窟。此外，还有若干分散的洞窟未全部编入。

东嘎石窟群共分为五个区，分别为第Ⅰ区至第Ⅴ区。