黔南民族医学高等专科学校现有杉木湖、青云湖和东山三个校区，校园总占地面积1167.17亩，校舍面积31.27万平方米，教学科研行政用房面积19.16万平方米。教学仪器设备总值1.61亿元，纸质图书80.82万册，电子图书45万册。教学医院、实习医院和企业等实习基地122家，专业实习对口率100%。截至2023年，学校设有医学系、护理系、药学系、医学检验系、医学影像系、口腔系、马克思主义教学部、基础医学部、公共课教学部、高等职业教育与成人继续教育部，第一附属医院（黔南州人民医院）、第二附属医院（黔南州中医医院）、附属都匀医院（都匀市人民医院）、附属匀东卫生院、临床技能实训中心、黔南民族卫生学校、职业技能等级认定机构等“六系四部四院一中心一校一机构”。

学校现开设有临床医学、中医学、口腔医学、针灸推拿、预防医学、中医康复技术、护理、护理（中医护理方向）、护理（老年护理方向）、药学、中药学、药品经营与管理、药品生产技术（中药制药方向）、助产、口腔医学技术、医学检验技术、医学影像技术、体育保健与康复等18个专业（专业方向），主要开展三年制专科、初中起点五年一贯制专科、成人继续教育和医学类、职业技能培训与等级认定工作。现有中央财政支持的专业能力提升项目2个，省级重点专业群2个、省级骨干专业3个、省级特色专业1个，特色骨干专业2个、教改重点专业1个，优秀教学团队3个、省级大师工作室1个、精品开放课程5门，省级开放实训基地及省级高水平专业化产教融合基地3个，省级职教名师4人，4门课程参与国家教学资源库建设。近年来，获省级教学成果奖一、二等奖2项，省级教育科学研究优秀成果二、三等奖4项，省级及以上技能比赛一、二、三等奖50多项。

目前，学校有在校生8000余人，面向全国24个省（自治区、直辖市）招生，生源充足，是贵州省考生报考的热门高职高专院校之一。学校坚持质量立校，毕业生基础知识牢固扎实，创新意识和实践能力强，受到用人普遍欢迎。建校以来，共为全州全省乃至全国输送了6万余名“下得去、留得住、用得上”的基层医药卫生人才，全州80%以上的乡镇卫生院院长为学校毕业生。

黔南民族医学高等专科学校前身为二十世纪七十年代上海市援建的黔南州第二人民医院。

1985年11，创建月黔南民族医学高等专科学校

2003年，黔南卫校并入学校。

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