| 序号 | 姓名 | 任期 | 简介 |
| 1 | 林文庆 | 1921年6月-1937年7月 | “海峡华人三杰”之一，在厦大任职16年，使厦大成为全国闻名的立案私立大学，并于1937年将厦大转为公立大学 |
| 2 | 田昭武 | 1982年2月-1989年9月 | 物理化学家，中国电化学学科带头人之一，中国科学院院士，出任两届厦门大学校长期间，集中精力抓好师资队伍建设和学科改革，大胆创新“文理渗透”的人才培养模式，从此厦门大学有了“三学期制”和“双学位制” |
| 3 | 萨本栋 | 1937年7月-1945年8月 | 物理学家、电机工程专家、教育家，中央研究院第一届院士，国立厦门大学第一任校长，创办了土木工程系、机电工程系并把理学院扩充成理工学院 |
| 4 | 汪德耀 | 1945年9月-1949年10月 | 著名的细胞生物学家、教育家，把厦大建立成为综合性的大学（五个学院十九个学系） |
| 5 | 王亚南 | 1950年5月-1969年11月 | 现代中国著名的经济学家和教育家，设立了经济研究所、化学研究所和南洋研究所；率先恢复《厦门大学学报》和创办《中国经济问题》杂志 |
| 6 | 林祖赓 | 1990年7月-1999年4月 | 电化学家，在厦大工作长达13年的时间里，使厦门大学成为国内学科门类最为齐全的高校之一，带动了一批面向21世纪的新兴学科的形成 |
| 7 | 陈传鸿 | 1999年4月-2003年5月 | 大力推动学科建设，积极扩大对外学术交流，为厦门大学物理学科的发展作出了重要贡献 |
| 8 | 朱崇实 | 2003年5月-2017年7月 | 坚持教学与科研相统一，坚持以学生为本的教育观，确立多元的精英教育质量标准，构建灵活弹性的人才培养机制 |
| 9 | 张荣 | 2017年7月-2022年3月 | 在其带领下厦门大学不仅顺利入选了首批世界一流大学A类建设高校，并有海洋科学等六个学科入选世界一流学科建设名单 |
| 10 | 邓萃英 | 1920年12月-1921年05月 | 首任校长，被推崇为“当代儒宗”和“新闻学”的代表人物 |
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