《中国国家重点保护野生植物名录（第一批）》列入野生植物250余种，其中，国家一级保护植物有玉龙蕨、中华水韭、光叶蕨、望天树等50余种，在所有一级保护植中被子植物种类最多，其中红豆杉是世界上公认的濒临灭绝的天然珍稀抗癌植物，是第四纪冰川遗留下来的古老树种，在地球上已有250万年的历史。
国家二级保护野生植物有白豆杉、白皮云、刺参、 马尾树等共200多种，在所有二级保护植物中受保护植物种类最多是木兰科植物，共有20种植物，其次种类数目最多的是豆科和松科，种类下都各有15种植物。
| 排序 | 中文名 | 学名 | 类别 |
| 1 | 光叶蕨 | Cystoathyrium chinense | 蹄盖蕨科 |
| 2 | 玉龙蕨 | Sorolepidium glaciale | 鳞毛蕨科 |
| 3 | *水韭属（所有种） | Isoetesspp. | 水韭科 |
| 4 | 巨柏 | Cupressus gigantea | 柏科 |
| 5 | 苏铁属（所有种） | Cycasspp. | 苏铁科 |
| 6 | 银杏 | Ginkgo biloba | 银杏科 |
| 7 | 百山祖冷杉 | Abies beshanzuensis | 松科 |
| 8 | 梵净山冷杉 | Abies fanjingshanensis | 松科 |
| 9 | 元宝山冷杉 | Abies yuanbaoshanensis | 松科 |
| 10 | 资源冷杉（大院冷杉） | Abies ziyuanensis | 松科 |
| 11 | 银杉 | Cathaya argyrophylla | 松科 |
| 12 | 巧家五针松 | Pinus squamata | 松科 |
| 13 | 长白松 | Pinus sylvestrisvar.sylvestriformis | 松科 |
| 14 | 台湾穗花杉 | Amentotaxus formosana | 红豆杉科 |
| 15 | 云南穗花杉 | Amentotaxus yunnanensis | 红豆杉科 |
| 16 | 红豆杉属（所有种） | Taxusspp. | 红豆杉科 |
| 17 | 水松 | Glyptostrobus pensilis | 杉科 |
| 18 | 水杉 | Metasequoia glyptostroboides | 杉科 |
| 19 | *长喙毛茛泽泻 | Ranalisma rostratum | 泽泻科 |
| 20 | 普陀鹅耳枥 | Carpinus putoensis | 桦木科 |
| 21 | 天目铁木 | Ostrya rehderiana | 桦木科 |
| 22 | 伯乐树（钟萼木） | Bretschneidera sinensis | 伯乐树科 |
| 23 | 膝柄木 | Bhesa sinensis | 卫矛科 |
| 24 | 萼翅藤 | Calycopteris floribunda | 使君子科 |
| 25 | *革苞菊 | Tugarinovia mongolica | 菊科 |
| 26 | 东京龙脑香 | Dipterocarpus retusus | 龙脑香科 |
| 序号 | 中文名 | 学名 | 类别 |
| 1 | 法斗观音座莲 | Angiopteris sparsisora | 观音座莲科 |
| 2 | 二回原始观音座莲 | Archangiopteris bipinnata | 观音座莲科 |
| 3 | 亨利原始观音座莲 | Archangiopteris henryi | 观音座莲科 |
| 4 | 对开蕨 | Phyllitis japonica | 铁角蕨科 |
| 5 | 苏铁蕨 | Brainea insignis | 乌毛蕨科 |
| 6 | 天星蕨 | Christensenia assamica | 天星蕨科 |
| 7 | 桫椤科（所有种） | Cyatheaceae spp. | 天星蕨科 |
| 8 | 蚌壳蕨科（所有种） | Dicksoniaceae spp. | 天星蕨科 |
| 9 | 单叶贯众 | Cyrtomium hemionitis | 鳞毛蕨科 |
| 10 | 七指蕨 | Helminthostachys zeylanica | 七指蕨科 |
| 11 | 水蕨属（所有种） | Ceratopteris spp. | 水蕨科 |
| 12 | 鹿角蕨 | Platycerium wallichii | 鹿角蕨科 |
| 13 | 扇蕨 | Neocheiropteris palmatopedata | 水龙骨科 |
| 14 | 中国蕨 | Sinopteris grevilleoides | 中国蕨科 |
| 15 | 贡山三尖杉 | Cephalotaxus lanceolata | 三尖杉科 |
| 16 | 蓖子三尖杉 | Cephalotaxus oliveri | 三尖杉科 |
| 17 | 翠柏 | Calocedrus macrolepis | 柏科 |
| 18 | 红桧 | Chamaecyparis formosensis | 柏科 |
| 19 | 岷江柏木 | Cupressus chengiana | 柏科 |
| 20 | 福建柏 | Fokienia hodginsii | 柏科 |
| 21 | 朝鲜崖柏 | Thuja koraiensis | 柏科 |
| 22 | 秦岭冷杉 | Abies chensiensis | 松科 |
| 23 | 台湾油杉 | Keteleeria davidiana var. formosana | 松科 |
| 24 | 海南油杉 | Keteleeria hainanensis | 松科 |
| 25 | 柔毛油杉 | Keteleeria pubescens | 松科 |
| 26 | 太白红杉 | Larix chinensis | 松科 |
| 27 | 四川红杉 | Larix mastersiana | 松科 |
| 28 | 油麦吊云杉 | Picea brachytyla var. complanata | 松科 |
| 29 | 大果青扦 | Picea neoveitchii | 松科 |
| 30 | 兴凯赤松 | Pinus densiflora var. ussuriensis | 松科 |
| 31 | 大别山五针松 | Pinus fenzeliana var. dabeshanensis | 松科 |
| 32 | 红松 | Pinus koraiensis | 松科 |
| 33 | 华南五针松（广东松） | Pinus kwangtungensis | 松科 |
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